随着财政国库收付制度改革的不断深入和向县、乡两级的延伸，财政监督由事后监督向事前防范、事中监控、事后检查的全程监督的转变，单位收支逐步透明化，一些不合理支出渠道没有了，但个别单位收入不上缴财政或私设“小金库”现象时有发生。主要表现在以下两方面：
一、 收入
1、 票据供应渠道不统一。有的单位收入使用的票据是由上级主管部门直接供应的；有的单位是一部分由上级主管部门直接供应，另一部分由财政部门供应；财政部门审核单位收入时，只能审核财政票据无法从源头上控制单位的收入情况。
2、 财政票据与自制票据混合使用有的单位为了逃避财政监督，单位收入时，按政策规定收取的费用使用财政票据；超标准收费的部分，使用自制票据。这样极易造成单位设置“账外账”或“小金库”，用以方 便日常支出。
3、 收入不开票现象个别存在。大部分执法执纪部门所依据的政策、法规都有伸缩性，其面对的行政相对人又是些违法乱纪的弱势群体，所以个别单位或其工作人员有的时候把公务活动当成有偿服务，把权利商品化，从中谋取私利，导致被罚者不索取或不敢索取票据的现象时有发生。
二、 支出
1、 实行集中支付后，支付中心按照行政事业单位会计制度进行同步核算，财政监督关口前移，实质就是财政在单位财务收支活动前，进行事前监督，但支付中心实际上只能对票据的合理性、合法性，发票日期、经办人、审批人签字等项目上进行审核，虽然可以逐步规范单位的票据使用情况但对单位票据的真实性却不能保证。
2、 县级企业和个体工商户大部分适用的是定额税，税务部门也往往根据单位税额完成情况发放税务票据。只要完成了定额税，税务部门就供应票据，对单位的税票控制不严，从而造成单位不合理支出能够变通为合理支出的较多，也较容易，使支付中心对单位支出的真实性很难，也不可能负责。
3、 县、乡两级许多实际支出由于是在农村发生或与小商贩、个体户打交道，往往没有正式票据，单位发生支出只好用白条。如果支付中心拒付这些白条，单位也只能对票据进行变通，但这往往又影响了单位支出的真实性。
三、 对策及建议
1、 统一票据供应渠道。为了从源头控制收入，应对票据供应渠道进行统一，由上级主管部门直接供应票据的，应在财政部门备案以便财政部门能从源头控制单位的收入，使单位的收入全部上缴财政。
2、 健全监督机制，加大稽查力度。财政部门应采取定期与不定期相结合，日常与专项相结合，事后与事前、事中相结合的方法对单位的财务进行监督检查，对查出的违纪情况加大处罚力度，使单位不敢触摸“账外账”或“小金库”这根高压线。
3、 进一步推进预算编制改革。集中支付后，经费的使用和管理将处于一种更开放、更透明的环境，这就要求从预算收入水平出发，细化、量化预算编制，全面推行部门预算、综合预算、零基预算，减少临时预算，科学反映各单位财务收支活动使预算编制工作进一步合法化、合理化、科学化、准确化，为财政直接支付或授权支付创造条件。
4、 与政府采购改革紧密衔接，相互促进，把政府采购工作推向一个新阶段。预算单位直接控制的支出项目和资金，将逐步被财政集中支付机构控制的支出项目和资金所替代，预算单位日常支出动用的现金将大大减少，支付中心的工作重点也将从现在的为预算单位办理资金结算转移到财政资金的审核支付上来。
