党的十六大以来，以胡锦涛同志为总书记的党中央结合我国社会政治生活发生的许多新变化，确立了“三个代表”重要思想的历史地位，做出了加强党的执政能力建设和党的先进性建设的重大战略部署，提出了构建社会主义和谐社会和落实科学发展观等一系列重大理论观点和方针政策。同时，根据新世纪新阶段党和国家事业发展的需要，对人民政协理论作了新的探索，深刻阐明了新世纪新阶段人民政协的性质、地位和作用，规定了新世纪新阶段人民政协肩负的历史任务和工作准则。
这些理论的主要内容可以概括为以下几个方面：1.开展政治协商、民主监督、参政议政，是人民政协的主要职能，也是发扬社会主义民主政治、建设社会主义政治文明的主要内容。胡锦涛指出人民政协的基本属性、组织构成、工作原则和活动方式，与构建社会主义和谐社会的要求是完全一致的，同构建社会主义和谐社会的各项工作是紧密相连的。构建社会主义和谐社会，必须充分发挥人民政协的作用，他讲明了人民政协与构建社会主义和谐社会这一重大战略任务的关系，指出了人民政协要为构建社会主义和谐社会服务的历史任务。2.明确了人民政协是中国共产党把马克思列宁主义统一战线理论、政党理论和民主政治理论同中国具体实践相结合的伟大创造，是中国共产党同各民主党派、人民团体和各族各界人士风雨同舟、团结奋斗的伟大成果。第一次把人民政协提升到了中国特色社会主义事业的重要组成部分的高度。3.系统论述了在新的历史条件下加强人民政协工作，发挥人民政协作用的必要性和重要性。强调了在新的历史条件下，要从提高党的执政能力、发展社会主义民主政治、推进中国特色社会主义伟大事业的战略高度充分认识和加强人民政协工作、发挥政协作用的必要性和重要性。4.根据形式的发展以及新世纪新阶段对人民政协工作的新要求，对人民政协的任务做出了新的规范和表述：高举爱国主义、社会主义旗帜，在热爱中华人民共和国、拥护中国共产党的领导、拥护社会主义事业、共同致力于中华民族伟大复兴的政治基础上，进一步巩固和发展爱国统一战线，把全体社会主义劳动者、社会主义事业的建设者、拥护社会主义的爱国者和拥护祖国统一的爱国者都团结起来，同心同德，群策群力，为推进社会主义经济建设、政治建设、文化建设、社会建设，为实现祖国完全统一，为维护世界和平、促进共同发展而奋斗。5.提出了人民政协的政治协商是中国共产党领导的多党合作的重要体现，是党和国家科学民主决策的重要环节，是提高党的执政能力的重要途径。明去了人民通过选举、投票形式权力和人民内部各方面在重大决策之前进行充分协商，尽可能就共同问题取得一致意见，是我国社会主义民主的两种重要形式。坚持和完善人民政协的这种民主形式，既符合社会主义民主政治的本质要求，又体现了中华民族兼容并蓄的优秀传统文化，具有鲜明的中国特色，是我国社会主义民主政治的一大优势。
党的十六大以来，中共中央关于人民政协的新思想、新观点和新要求，充分体现了实事求是、开拓创新的精神，丰富和发展了人民政协理论，也推动了人民政协事业继续向前发展。