国库集中支付与会计集中核算接轨，是近年来财政改革的创新，之前各地没有可遵循的模式，竹溪县在完整的会计集中核算基础上，成功地将国库集中支付与会计集中核算结合运用，实现了单位会计核算和财政资金拨付的系统化和规范化，在财政改革的进程中探索出了一条新路。
2001年底，根据《湖北省人民政府关于试行财会集中核算制和零户统管工作的通知》（鄂政发[2001]79号）精神，为加强单位财务管理，从源头上预防和治理腐败，经县委政府研究决定在我县全面推行财会集中核算制。通过精心筹备，竹溪县会计核算中心于2002年4月28日正式成立,运行后的一年时间内，县直101个行政事业单位的财务全部纳入了集中核算，并为各种专项资金设立专用账套，为此中心共建立账套132个。我县属全省29个贫困县之一，2004年，随着全省财政四项制度改革的全面铺开，我县也积极推行了国库集中支付制度改革，鉴于刚组建不到两年的集中核算的办公点、人员、设备等基本完善，为减少不必要的成本耗费，我们采取了将集中核算与集中支付并轨运行的方式，确保国库制度改革的稳步实施。6月，成立国库收付中心，当年12个试点单位上线运行并取得实效，到2006年7月，县直83个一级单位全部实行了国库集中收付，初步形成了以国库单一账户体系为基础、资金缴拨以国库集中收付为主要形式的现代财政国库管理体系。
在具体操作中，按照“统筹规划、分步实施、逐步到位”的工作思路，坚持先试点、后推广、有计划、分步骤地实施。首先对两个中心内部进行整合，实行“两块牌子，一套人马，柜组业务分开”的“收付+核算”的运作模式，充分利用现有人员、设备和技术力量，为预算单位办理核算和支付业务。对于预算单位条件成熟的，由单位直接联接国库集中支付系统，单位人员自行操作业务，条件成熟一个，退账一个，同时将核算权返回给单位，中心为其开设集中支付的零余额账户；对于单位业务量小、经费少，会计基础差，不具备独立完成国库集中支付业务的单位，实行国库收付中心代理操作；对于非财政预算的自收自支单位、差额单位、底级单位，继续实行会计集中核算。国库收付中心共设立五个集中代理柜组，既代理集中支付业务，又代理核算业务，做到收付、核算两不误。从2004年至今的5年时间里，经历了集中并账、分户核算、转轨并行、集中支付等一系列的业务探索，核算系统弥补了支付系统的薄弱功能，支付系统规范了资金拨付流程，两个中心、两个系统、一套人员、一套设备，不但节约了人力物力，而且充分发挥了两个系统各自的优势，到2007年底国库集中支付和会计集中核算均已步入科学化轨道，全县所有财政性资金全部纳入了系统内管理，财政拨款和会计核算均实现了电子化。
国库集中收付制度改革是一项复杂的系统工程，横向覆盖面广，纵向深入彻底，是一项全新的事物，要求业务人员不但要有会计基本知识，还必须有一定的计算机专业技能，这项改革改变了过去传统的财政资金管理模式和预算单位会计核算方法，变动幅度很大，不管是预算单位还是财政内部都有一个适应的过程。通过有效地将国库集中支付与会计集中核算双轨并行，前者保证了财政资金的安全高效拨付过程，后者规范了单位财务核算行为，形成了一个完整、安全的财政资金监管体系，同时两者并举也将改革中遇到的各种现实矛盾化解到了最低限度。
实行国库集中收付后，规范了资金缴拨程序，强化了财政性资金的监管力度。其一，财政资金由原来分散管理变为集中管理，对单位使用资金实行计划管理，凡是未最终实现支付的资金均积存在财政部门，因此财政部门管理的库存资金显著增加，有效的增强了政府的调控力度；其二，国库收付系统通过国库单一账户体系和资金集中管理办法完成支付的全过程，体现出预算管理的制度化、规范化、公开化，实现预算单位的财务先有预算、再有计划、后有支出的完整过程，财政资金从预算分配、资金拨付、资金使用等过程中，全程都能受到跟踪监督，实现了由“以拨代支”向“以支列支”的本质转变，有效解决了长期以来财政预算支出与单位财务支出信息不对称问题；其三，减少了财政资金中转环节，职工工资直接支付到个人工资账户，采购资金直接支付给商品及劳务供应商，零星小额支出财政授权由单位支付，财政资金不再通过主管部门层层转拨，单位用钱不见钱，有效遏制了滞留、挤占、挪用资金现象，极大地提高了财政资金的使用效率；其四，对各单位的所有收入，按其不同的资金性质，全部缴存到国库或预算外资金财政专户，确保了财政收入“一本账”的完整性。
只要是改革，就必然有矛盾，特别是近几年的财政改革涉及面宽、力度大，在两个中心的双轨并行中，由于完全打破了传统的操作模式，业务程序发生了本质改变，改革途中也出现过一系列的实际问题。国库集中支付体系建立后，取消了各预算单位的所有账户，对预算单位的代扣款、往来业务操作非常不便，为保证日常业务的正常运行，我们通过与单位沟通，结合实际制定了可行的操作办法。
在国库集中收付系统运行初期，由于软件功能不完善，对试点单位所发生的各种代扣资金和往来业务无法处理，为不影响业务的正常开展，当时采取由预算单位在商业银行开设代扣资金账户这一应急措施，一时缓解了代扣资金无法结算的矛盾，为预算单位资金结算提供了方便。但是，随着集中支付单位量的增加，代扣和往来业务也成倍增加，这一作法违背了国库制度改革的初衷，使少数单位钻了空子，将应上缴财政专户的资金存放在代扣账户中以逃避财政部门的监管。发现这种作法的弊端后，我们迅速采取果断措施，根据国库单一账户管理规定，结合我县实际制定了《竹溪县预算单位代扣款项财务操作办法》，由国库收付中心开设一个代扣账户，统一办理预算单位的代扣业务，堵截了单位体外循环资金的不良行为，进一步完善了国库单一账户体系。
加强业务培训，解决业务人员的后顾之忧是改革顺利推进的前提。2005年7月，针对上线单位人员业务水平参差不齐的实际情况，为扶持他们尽快熟练掌握新的业务流程，我们在总结国库改革试点操作经验的基础上，结合各单位的业务事例，组织人员编写了近3万字的《实用财会业务培训资料》，这些符合实际、简学易懂的学习资料深受会计人员的欢迎，中心在40天时间内成功举办了3期以财政内部业务股室和县直预算单位人员参加的培训班，县直100多个单位财务人员参加了培训。
截止2007年底，县直83个行政事业单位和15个乡镇的所有资金全部纳入了国库集中收付系统支付，改革的单位面和资金量均达到100%，在稳步推行国库集中收付制的同时彻底理顺了各单位的财务核算系统，在全市率先实现了会计集中核算系统与国库集中收付系统的对接并行，圆满完成了省市主管部门下达的改革任务，在全省财政国库制度改革验收中荣获A等次，受到省财政厅的通报表彰。
